期刊:Cancer Discovery
IF:30.6
发表时间:2024 Aug 2
文章简介:
作者通过多组学分析,定义和分析了五种人巨噬细胞亚群及它们在乳腺癌和肠癌中的空间分布特征,发现它们并非随机分布于组织中,而是占据了具有独特细胞组成的空间独特生态位,并对患者的预后产生了不同的影响。
样本策略:
4个公共单细胞转录组测序数据集(涵盖了乳腺癌和结直肠癌),来自37名结直肠癌和乳腺癌患者的65例CODEX实验和包含31个组织微阵列的CosMx实验(囊括结直肠癌、乳腺癌和克罗恩病病例),1个Visium公共空间转录组测序数据。
应用技术:
scRNA-seq,CODEX,CosMx,Visium等。
研究亮点:
(1) 揭示巨噬细胞亚群的空间分布与结肠癌患者预后相关,如IL4I1+ 巨噬细胞与良好的预后相关,而 SPP1+ 巨噬细胞与不良预后相关。
(2) 揭示了不同巨噬细胞亚群在肿瘤微环境中的不同功能。如,IL4I1+ 巨噬细胞在高细胞周转区域参与凋亡细胞的吞噬作用, SPP1+ 巨噬细胞则与缺氧和坏死的肿瘤区域相关和NLRP3+ 巨噬细胞与激活炎症体和中性粒细胞浸润相关等。
研究意义:
这项研究扩展了我们对不同巨噬细胞群体在癌症生长中可能发挥的不同作用的理解,并揭示了潜在的预测标志物和巨噬细胞群体特异性治疗靶点。
文献原文(DOI):10.1158/2159-8290.cd-23-1300