热点新闻
Milo | 细胞分布差异
2023-07-16 02:19  浏览:865  搜索引擎搜索“手机展会网”
温馨提示:信息一旦丢失不一定找得到,请务必收藏信息以备急用!本站所有信息均是注册会员发布如遇到侵权请联系文章中的联系方式或客服删除!
联系我时,请说明是在手机展会网看到的信息,谢谢。
展会发布 展会网站大全 报名观展合作 软文发布







Milo是一个检测细胞分布在不同实验条件下差异的算法(https://github.com/MarioniLab/miloR )。






主要原理:先根据KNN方法进行细胞抽样,对抽样后的细胞用KNN找它的邻近细胞,图c里面每个圈代表一个抽样的细胞,圈的大小代表临近细胞数量的多少。细胞之间的连线代表这两个细胞共享多少个邻近细胞,线越粗共享的邻近细胞数量越大,之后检验每个细胞的邻近细胞中来源于不同实验条件的细胞数量是否存在显著差异。显著富集某个条件的细胞就会标那个条件的颜色,最后看在整体UMAP空间上,哪个区域集中有某个条件的颜色,说明这个区域的细胞就在那个条件富集,与那个条件相关。

参考文献:Nature Biotechnology, 2022, 40, 245–253.

发布人:d8b5****    IP:101.229.24.***     举报/删稿
展会推荐
让朕来说2句
评论
收藏
点赞
转发